普通FISH多采用单条长片段探针,依靠酶促标记+后续信号放大,适合基因/染色体定性定位,只能做批量信号判读,无法区分单个RNA分子;放大过程易引入定量偏差,非特异结合升高假阳性风险。smFISH虽和传统FISH基于核酸碱基互补杂交原理,但采用多短探针协同结合策略:同一条靶RNA上结合数25-48条独立荧光标记寡核苷酸,无酶促信号放大,多个探针荧光叠加形成独立荧光亮点,1个亮点对应1条RNA转录本,实现RNA单分子原位成像与绝对定量。而smFISH实验成功的关键就在于成套探针池的设计与合成,自主开发探针往往面临多重技术难点。
smFISH探针设计核心难点
smFISH探针池开发,并非简单批量合成寡核苷酸。整套探针的一体化设计是实验成功的关键,也是很多课题组自主开发的卡点。
整套探针统一GC、Tm值,确保同条件下杂交效率均衡,体系稳定。
避开折叠遮蔽位点,挑选高可及性靶序列,提升探针结合效率。
排查探针二聚与非特异结合,减少杂信号,成像背景干净。
单点共价标记,避免染料自淬灭,单分子荧光亮点清晰。
德奥平smFISH探针设计合成服务
实现单分子RNA精准定量
德奥平提供一站式smFISH探针设计合成服务,针对每条RNA设计约40-48条特异性探针,提前完成多维度序列评估与筛选,帮助客户减少大量试错实验,加速科研转化。
靶序列评估
探针设计
序列筛选与脱靶预测
oligo合成
荧光标记
纯化
整套探针池混合质控
smFISH产品优势
✓ 成套探针一体化设计,统一Tm、GC参数,杂交条件匹配度高;
✓ 多探针协同识别,大幅降低单探针脱靶带来的假阳性;
✓ 探针末端单点荧光标记,规避染料自淬灭,信噪比优异;
✓ 一站式交付,包含序列设计、合成、标记、纯化全套服务;
smFISH科研应用方向
smFISH可广泛用于发育生物学、细胞分化、疾病机制、神经科学等方向的基础研究,同时可用于空间组学测序结果的原位验证。
∠ 发育生物学、细胞分化相关基础研究
∠ 疾病发生分子机制探究
∠ 神经科学方向RNA原位观测
∠ 空间组学测序结果原位验证