随着二代测序技术在高通量测序领域的广泛应用,RNA高通量测序技术也逐渐成熟,在小RNA(small RNA)文库构建过程中,为了避免RNA分子的自连,减少文库中RNA嵌合体的存在,需要对接头进行5’-腺苷酸化修饰。5’-腺苷酸化oligo可以连接不同序列的3’-OH端,通常用于连接3’端为羟基的单链DNA或miRNA,常用于文库构建[1]。
| rAPP的应用——miRNA高通量测序文库构建
由于体内非编码miRNA很短(21-23 nt),包含5'-磷酸基团和3'-羟基末端,在使用T4 RNA连接酶和ATP将接头连接到miRNA末端构建文库时,常会发生miRNA自连(self-ligation),难以构建高质量miRNA文库,使用5'-rApp修饰的oligo接头可以有效避免这个问题。
基于专业的研发团队及成熟高效的合成纯化生产平台,现提供5‘腺苷酰化修饰,可化学合成5’腺苷酰化Oligo,应用于下游miRNA建库等相关场景。
自主合成rApp腺苷酰化核酸,经过质谱检测及UPLC纯化的双重质控,合成产物具有高纯度、高精准的优势特性。
● 序列5rAPP-P:
(Adenylation)CGTCTATAGTGATTAGTATTCCA(NH2-C7)
● Mass质谱-分子量7646.6
● UPLC检测-纯度98.56%
在 miroRNA (miRNA) 的研究领域,LNA因其独有的极高亲合性、专一性与稳定性使其特别适合用来检测、辨別相似的短核酸序列。2007年Nature Protocols 期刊中即有专文报道LNA在 miRNA 的原位杂交检测实验中 (in situ hybridization) 具有前所未有的专一性与检测效能 (Nat Protoc.2007;2(6):1508-14.)。
LNA探针具有比 DNA 探针更佳的序列专一性,其完全配对与专一位置不完全配对的双股序列之间的 Tm 值差异高达26°C,因此比起一般 DNA 探针更能避免非专一性结合的情况发生。
可根据客户的设计序列或LNA修饰要求,如修饰位点、数量、磷酸化需求提供定制化寡核酸合成服务。
自主合成LNA锁核酸,经过质谱检测及UPLC纯化的双重质控,合成产物具有高专一性、高稳定性的优势特性。
● 序列ASOLNA-P :
(LNA-T)*(LNA-T)*(LNA-G)*A*A*C*C*G*T*C*C*C*T*T*C*T*(LNA-C)*(LNA-C)*(LNA-C)
● Mass质谱-分子量6149.2
● UPLC检测-纯度99.25%